但是这件事却在武帝的心中种下了一颗阴霾的种子，为以后的巫蛊之祸留下深重的祸根。

武帝天汉年间，国内流行疫病。这种疫病最初可能来自匈奴发动的生物战。由于汉武帝不断对匈奴发动大规模战略进攻，匈奴王庭远迁漠北，为阻挡汉军，匈奴使用“胡巫”的萨满巫术。

这种巫术的“诅军”方法之一，是将疫马、牛、羊埋到汉军经过的水头水源上，或将染有烈性病毒的疫马施放给汉军，使汉军人畜染疫。疫病随归师传回长安，相传一代名将霍去病在二十三岁的青壮之年早夭，肯定是由于染上了不治的疫病。（元狩年后，匈奴连续数位单于均以青壮年短命早夭，可能也是死于疫病。

武帝中后期以后疫病流行国中，汉宫人多染疫者，武帝晚年也染疫多病，所以那日刺客事件，令汉武帝疑心大起，他怀疑自己中了巫蛊之术。

丞相公孙贺的夫人是皇后卫子夫的姐姐，而他的儿子公孙敬则是一个无所不作的浪荡公子，为了满足他的私欲，这位公孙公子动用了军费一千九百万钱，结果事情被人告诉发，为了救儿子，公孙贺不得不亲自亲婴去追捕阳陵侠朱安世，为儿赎罪，汉武帝考虑再三同意了，于是朱安世终被公孙贺抓获，结果朱安世怀恨在心，将公孙贺告发与巫蛊一事有关，于是公孙一家被下狱。

结果廷尉杜周奉旨处理此案，于是阳石公主，诸邑公主，卫伉，两名公主为卫皇后所生，而卫伉则是大将军卫青之子，这些全是卫皇后一脉所属，均被处死，整个事件在长安城内引起轰动，涉及的人，无一不被处死，一时间，长安城的上方，那乌云压得每个人都喘不上气来。

所为巫蛊之术，巫蛊之术的具体方法，就是以桐木制作小偶人，上面写上被诅咒者的名字，生辰八字等，然后施以魔法和诅咒，将其埋放到被诅咒者的住处或近旁。行此术者相信，经过这样的魔法，被诅咒者的灵魂就可以被控制或摄取。

战国晚期及汉代，由于民族的迁移与混合，巫术之风浸染中原，逐步由下层流行至上层，战国后期著名的邹衍就是一位大巫，而到了汉代更是极为的流行于中原各处，

发生在汉武帝晚年的巫蛊案，是西汉时期非常重大的历史事件，此案引起了汉武帝晚期政治的重大转变，但是，为什么会发生此案，则一直扑朔迷离，异说纷纭，成为武帝一生历史中的一个巨大迷团，没有人能说出是为什么。

汉武帝在中国历史是一个非常强势的帝王，在他的一生，汉朝的疆土极为辽阔，出现了万国来朝的盛世之景，尤其是对匈奴的用兵，更是其重要一项功勋，但就是这样的一个风云人物，却在自己的晚年，杀了自己的女儿，儿子，卫后，甚至后来的为了能让儿子做好帝王这个位置，将儿子的母亲，他一个庞妃，钩戈夫人，这就是历史上著名的杀母立子事件！

在汉武帝的身上围绕着迷一样的色彩，在他在位期间，丞相换了数人，而且几乎没有一个好下场，高官更是频繁的更换！